Wie der Name schon sagt, ist der FSC ursprünglich ein Flensburger Klub und die Boote lagen keineswegs wie heute in Glücksburg, sondern im ersten Jahrzehnt seines Bestehens ohne "echten" Platz verstreut an Brücken und Pfählen vor der Ballastbrücke in Flensburg.

Im Jahre 1899 erfolgte dann ein Gesuch an die Stadt Flensburg, dem Segelklub ein geeignetes Bootshafengelände zuzuweisen und zwei Jahre später, 1901, erfolgte die Zuweisung einer Land- und Wasserfläche wie vorgeschlagen an der Nordseite des Hakens bei Vith nördlich der Ziegeleibrücke (Hier im Plan von 1846).